Фамилия Мусаковский звучит как типичная «географическая» фамилия, и это первое, что бросается в глаза. Суффикс -ский указывает на происхождение от названия места: такую фамилию обычно получал человек, владевший землёй в некоем Мусакове или Мусаках, либо переселившийся оттуда. В польской и украинской традиции фамилии на -ский были дворянскими и указывали на родовое поместье, но в русской среде их могли носить и священники, и выходцы из мещан, и даже крестьяне, если они переезжали из деревни с похожим названием.

Теперь о корне. Основа «Мусак» или «Мусаков» неочевидна. Самое простое объяснение — это топоним: на картах встречаются населённые пункты Мусаково (например, в Башкортостане или в Беларуси) и Мусаковка (в Украине). Но есть и версия, что в основе лежит личное имя Муса — тюркское имя, широко распространённое у татар и башкир, которое иногда встречается и у славян в южных регионах. Если так, то Мусаковский — это человек из рода Мусы, то есть потомок носителя имени Муса. В таком случае фамилия прошла двойную обработку: сначала от имени Муса образовали притяжательное «Мусаков» (сын Мусы), а затем добавили шляхетский суффикс -ский, что характерно для регионов, где смешивались славянская и тюркская ономастика, например, на Подолье или в бывшем Великом княжестве Литовском.

Реже, но стоит упомянуть: в некоторых говорах «мусак» могло быть прозвищем — от «мусолить» (пачкать, возиться) или от диалектного «мусак» (неряха). Однако эта версия слабая, потому что суффикс -ский редко крепится к прозвищам с бытовым значением — для этого обычно использовали -ов или -ин. Куда правдоподобнее, что фамилия «географическая» или «потомственная» от имени.

С точки зрения социального контекста: если Мусаковские были дворянами, их род мог упоминаться в гербовниках Царства Польского или Малороссии. Если же фамилия крестьянская, то она скорее всего закрепилась в XIX веке, когда после отмены крепостного права бывшим крепостным давали фамилии по названиям деревень, откуда они происходили. Точных данных о знаменитых носителях нет, но фамилия встречается в основном на западе России, в Беларуси и в Украине, что подтверждает её западнорусское или польско-литовское происхождение.