Фамилия Мусакина — женская форма фамилии Мусакин, которая образована по самой распространённой в русской ономастике модели: от прозвища или имени, оканчивающегося на -а, с помощью притяжательного суффикса -ин. В основе лежит личное имя или прозвище Мусака. Это уменьшительная форма от крестильного имени Моисей (древнееврейское «спасённый из воды») или от редкого, но известного в южнославянской и тюркской среде имени Муса — арабского варианта библейского Моисея. В русских говорах слово «мусак» или «мусака» могло иметь и самостоятельное значение: в некоторых диалектах так называли бродягу, нищего или человека, который «мусает» (сосёт, тянет), но эта версия менее вероятна, так как фамилия фиксируется в основном в центральных и южных регионах России, где сильны церковные традиции имянаречения.

Разберём словообразовательную цепочку: Моисей → Муса (народная форма) → Мусака (уменьшительно-ласкательный суффикс -к-) → Мусакин (сын Мусаки) → Мусакина (дочь или жена Мусакина). Суффикс -ин указывает на принадлежность, то есть фамилия буквально значила «чей?» — «Мусакин», то есть «ребёнок, потомок Мусаки». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён на -а, -я (ср. Ильин, Фомин, Кузьмин). В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще давали от имён на твёрдый согласный, -ин чётко привязывает основу к женскому или ласкательному окончанию.

Географически фамилия Мусакин и её женская форма Мусакина встречается нечасто, но имеет очаги распространения в Рязанской, Тамбовской и Воронежской областях, а также среди казачества. Это наводит на мысль, что предки носителей фамилии могли быть крестьянами или однодворцами, получившими фамилию по имени отца в XVII–XIX веках. В официальных документах фамилия фиксировалась поздно, поэтому вариативность написания (Мусакин/Мусакина) сохраняется только в родовых окончаниях, а сама основа остаётся устойчивой.

Ономастический словарь Б. Унбегауна относит подобные фамилии к разряду «патронимических на -ин», без экзотических заимствований. Спор о тюркском происхождении основы (имя Муса действительно встречается у татар и башкир) не отменяет того, что суффиксальное оформление — чисто русское, а значит, фамилия Мусакина — это результат адаптации иноязычного имени в русской крестьянской среде. Если ваши предки носили эту фамилию, скорее всего, они были православными и жили в чернозёмной полосе, а их родоначальника звали в быту Мусака — сокращённо от Моисей.