Фамилия Мушкетов образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Мушкетов образована от прозвища Мушкет, которое восходит к нарицательному «мушкет». Мушетом (от фр. Mousquet) называют ручное огнестрельное оружие, дальнозарядное ружьё XVI века, появившееся первоначально в Испании в 1521 году и заменившее в армиях более примитивную аркебузу. Мушкеты обязаны своим появлением изобретению зернистого пороха, кардинально облегчавшего зарядку длинноствольного оружия. Кроме того, зернистый порох сгорал более полно и равномерно. Это привело к витку усовершенствования технологий, позволивших производить длинные стволы лучшего качества. Позже термин «мушкет» часто применялся к любым дальнозарядным ружьям. Мушкеты как массовое ручное стрелковое оружие просуществовали до второй половины XIX века, когда им на смену пришло казнозарядное ручное стрелковое оружие. Исходя из этого, можно предположить, что основатель рода Мушкетовых был оружейником. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Мушкет, со временем получил фамилию Мушкетов. О точном месте и времени возникновения фамилии Мушкетов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Мушкетов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.