Фамилия Мушлайкин — редкая и неочевидная для быстрого разбора. Кажется, что в ней слышится что-то восточное, но на деле это почти наверняка русская фамилия, образованная от прозвища. Ключ к её пониманию — суффикс -айк-, который встречается в русских именах и прозвищах, особенно в северных и центральных говорах. Суффикс придаёт слову оттенок уменьшительности, ласкательности или, наоборот, ироничной снисходительности. Мушлайка — так могли называть человека с мягким, «мушластым» характером или с какой-то особенностью поведения.

Основа фамилии — Мушлай. Скорее всего, это прозвище связано с диалектным глаголом «мушлать». В некоторых русских говорах (например, ярославских, костромских) «мушлать» означало «мять, комкать, делать небрежно». Отсюда «мушлай» — тот, кто делает всё кое-как, неаккуратный работник, или человек, который постоянно мнёт, трогает что-то руками. Возможен и второй вариант: «мушлаться» — возиться, медлить. Тогда Мушлай — медлительный, копотливый человек.

Менее вероятна, но не исключена связь с тюркскими языками. Слово «муша» (в разных диалектах) может означать «кошка» или «рысь». В таком случае Мушлай — человек, прозванный за кошачьи повадки, ловкость или хитрость. Однако русский суффикс -ай- и типично русская модель образования прозвищ делают первую версию гораздо убедительнее.

Фамилия оформлена по стандартной русской модели: к основе Мушлай- добавили суффикс притяжательного прилагательного -кин (сокращённый вариант от -ин после основы на -й). Вопрос «чей?» — Мушлайкин, то есть сын, потомок Мушлая. Это фамилия недворянского происхождения, крестьянская или мещанская. Географически корни стоит искать в северных и центральных областях России: Ярославская, Костромская, Вологодская губернии. Там же фиксируются однокоренные фамилии вроде Мушлаков, Мушлаев — все они, скорее всего, вышли из одного гнезда прозвищ, связанных с понятием «мушлать».

Таким образом, предок Мушлайкиных — это, по всей видимости, нерасторопный или небрежный работник, которого в деревне дразнили Мушлаем. Прозвище закрепилось, перешло в фамилию и прошло через века, потеряв свой первоначальный ироничный смысл.