Фамилия Муштайкин образовано от имени Муштайка, которое является диалектным вариантом мусульманского мужского имени Муштак. Это имя в переводе на русский означает «влюбленный, готовый отдать всю душу». Согласно другой версии, имя Муштай является одним из диалектальных вариантов имени Муштари, которое в переводе означает «юпитер», «пайщик, компаньон». Вероятно и то, что именование Муштайка восходит к диалектному украинскому слову «муштай» - так на Украине называли коней с густой длинной шерстью. Вероятно, прозвище Муштай, послужившее основой для этой фамилии, указывало на внешний вид предка, например, густые волосы, бороду. Менее вероятно, что прозвище Муштай получил конезаводчик. Таким образом, потомок человека, которого звали Муштайка, со временем получил фамилию Муштайкин.