Фамилия Муштин — редкий случай, когда в основе, скорее всего, лежит не имя и не профессия, а внешняя черта или свойство характера. Если отбросить суффикс -ин (который в русских фамилиях отвечает на вопрос «чей?» и указывает на принадлежность), остаётся корень «мушт-». Самое прямое и очевидное объяснение — прозвище Мушта от слова «муштра». В русских говорах «муштрой» называли не только военную выучку, но и вообще строгое, придирчивое обращение, а «муштовать» значило «заставлять, мучить, изнурять работой». Прозвище Мушта могли дать человеку суровому, требовательному или, наоборот, тому, кто сам много и тяжело работал, «муштровал» себя.

Однако есть и другая версия, менее заметная, но не менее интересная. В южнорусских и украинских говорах «муштей» или «мушта» — это форма обращения «моштэ» (от польского możesz — «можешь») или искажённое «мусье». Такое прозвище мог получить человек, который щеголял, старался говорить «по-благородному», или, напротив, приезжий иностранец, которого в деревне дразнили за манеры. Эта версия объясняет, почему фамилия встречается не только в центральной России, но и на западе, в бывших польских губерниях.

Географически Муштины не образуют одного большого гнезда. Фамилия разбросана: её носители есть на Урале, в Поволжье и в Черноземье. Эта разрозненность говорит в пользу того, что прозвище возникало в разных местах независимо — то от строгого нрава, то от «барских» замашек. В отличие от фамилий на -ский, которые часто принадлежали духовенству или дворянам, Муштин — типичная фамилия крестьянская или мещанская, образованная по простой модели «прозвище + -ин». Социального статуса выше среднего она не давала, но и редкой её не назовёшь — она встречается ровно настолько, чтобы у её носителей была реальная возможность найти однофамильцев в соседней области.