Фамилия Муштина звучит на слух как производная от слова «муштина» — так в ряде говоров называли кулак, сжатый для удара, или что-то сжатое в кулак (например, горсть табака). Но здесь есть важный нюанс: полногласная форма «муштина» в русских диалектах встречается реже, чем «мштина» или «мщатина», и почти всегда с оттенком грубой силы. Скорее всего, прозвище Муштина получил человек с тяжёлым кулаком — либо драчун, либо, наоборот, тот, кто работал с усилием рук, например кузнец или молотобоец.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Муштина — это «сын Муштины» или «человек из рода Муштиных». В русской ономастике такие фамилии чаще всего образовывались от прозвищ на -а, -я, поэтому Муштина — это не женская форма, а исходное мужское прозвище, которое затем закрепилось за потомками. Фамилия недвусмысленно говорит о характере или занятии предка, без примеси иноязычных корней.

Географически фамилия Муштина встречается в основном в центральных и южнорусских областях — в Тамбовской, Воронежской, Рязанской губерниях. Это зона, где диалектное слово «муштина» действительно бытовало в речи. В северных и сибирских регионах фамилия редка, что косвенно подтверждает её диалектное происхождение.

Интересно, что однокоренные фамилии — Муштов, Муштаков, Муштаев — образованы от той же основы, но с разными суффиксами. Муштина стоит особняком: она сохранила форму прозвища в чистом виде, без наращения -ов или -ев. Это говорит о том, что фамилия могла закрепиться раньше, чем массовый переход прозвищ в стандартные патронимы, или в среде, где суффикс -ин был основным способом фамилизации (например, в некоторых южнорусских уездах).

Версия о связи с украинским или польским «муштра» (муштра, обучение) маловероятна: ударение в фамилии падает на второй слог (Муштина́), а в заимствованном слове — на первый. Кроме того, суффикс -ина в значении «жена муштровщика» не дал бы такой фамилии — она бы звучала как Муштрова. Так что основная, и самая правдоподобная, версия — диалектное прозвище по кулаку.