Фамилия Мусис — редкий случай, когда происхождение почти наверняка указывает на литовские корни. В русском языке фамилии на -ис, -ус, -ас (Балтрушайтис, Киркилис, Мусис) — это маркер балтского, чаще всего литовского, происхождения. Такие фамилии не прошли через славянскую суффиксацию (-ов, -ин), а сохранили литовскую патронимическую форму: окончание -is указывает на принадлежность, примерно как русское «чей?» — «Мусис» буквально значит «Мусин» или «относящийся к Мусю».

Основа фамилии — короткое личное имя или прозвище Musis (лит. Mūsys). В литовской антропонимии это имя могло быть производным от слова musė — «муха». Прозвище «Муха» было распространено у многих народов: его давали либо назойливому, суетливому человеку, либо, наоборот, тому, кто был мал ростом и быстр. В польской и белорусской традиции тоже встречается фамилия Муха (Mucha), но литовская форма Мусис — это именно балтский вариант с характерным окончанием.

Не исключена и более редкая версия — связь с литовским mušti («бить», «колотить»). В таком случае прозвище Mušis мог получить драчун или человек с тяжелой рукой. Однако эта гипотеза менее вероятна: звуковой переход š > s в литовском нерегулярен, и фамилии от глагола mušti чаще выглядят как Mušinskas или Mušis именно с шипящим.

Географически фамилия Мусис почти целиком привязана к Литве и прилегающим районам Беларуси (особенно Витебщина и Гродненщина). В России она встречается редко и, как правило, у потомков литовских переселенцев конца XIX — начала XX века. Сословной принадлежности у фамилии нет: в Литве такие патронимы носили и крестьяне, и мелкая шляхта, и мещане. Социальный статус предка можно было бы уточнить только по конкретным архивным записям, которых по этой фамилии, скорее всего, сохранилось немного.

Таким образом, если вы носите фамилию Мусис, ваши предки, вероятнее всего, были литовцами (или литвинами) и получили фамилию по прозвищу, связанному с мухой. Это не героическая и не дворянская история, но зато — короткий и ясный след из прошлого, который ведет прямиком в балтийские говоры.