Фамилия Мустипаненко — характерный пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели с суффиксом -енко. Этот суффикс в XVI–XVIII веках в Поднепровье и Слобожанщине выполнял роль отчества или указания на принадлежность к роду: Мустипаненко буквально значит «сын (или потомок) Мустипана». Сама основа Мустипан — это фонетически изменённая форма имени Анастасий или, что вероятнее, Феостип (Феостипет). В народной речи сложные греческие имена нередко упрощались: отбрасывались начальные слоги, переставлялись звуки. Так Феостип превращался в Хвестип, а затем в Мустип или Мустипан. Вторая версия — основа могла быть не каноническим именем, а прозвищем, связанным с украинским диалектным словом «мустити» (мстить) или «муст» (настой, сок), но это менее вероятно: суффикс -енко обычно присоединяли к полным именам, а не к чистым глагольным корням.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины — Полтавщине, Черкащине, Сумщине. В метрических книгах XIX века Мустипаненко встречаются в казацких сёлах, где фамилии на -енко были нормой. Редкость фамилии объясняется тем, что исходное имя Мустипан не получило широкого распространения даже в украинской народной среде: оно осталось локальным вариантом, не перешедшим в разряд частых. В отличие от массовых Шевченко или Коваленко, Мустипаненко — фамилия с узкой родовой привязкой, возможно, берущая начало от одного конкретного человека по имени Мустипан, жившего в одном-двух селениях.

Интересно, что написание фамилии устойчиво: в документах XIX века почти не встречается вариантов вроде «Мустепаненко» или «Мостипаненко». Это говорит о том, что носители чётко осознавали своё родовое имя и передавали его без искажений. Если ваш предок носил эту фамилию, он почти наверняка происходил из среды свободных сельских обывателей — казаков или государственных крестьян, а не из крепостных помещичьих имений, где фамилии часто записывали на слух и с ошибками.