Фамилия Музафаров имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Музафаров уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Музафаров являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Музафаров ведет свое начало от мусульманского мужского имени Музаффар, которое в переводе с арабского языка означает «победитель, тот, кто одерживает верх», «достигающий цели». Вполне вероятно, что родители, нарекая свое сына такми именем, желали ему стать целеустремленным, удачливым человеком. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Музафаров способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Музафаров представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.