Фамилия Музфарова — женская форма, образованная от мужской Музфаров. В основе фамилии лежит арабское мужское имя Музфар (Мозаффар, Музаффар), которое переводится как «победоносный», «одерживающий победу». Это имя распространено у народов, исповедующих ислам, — татар, башкир, народов Кавказа и Средней Азии. В русской среде фамилия встречается редко и почти всегда указывает на тюркские или мусульманские корни предка.

Словообразовательная модель здесь простая: к основе Музфар- добавлен русский патронимический суффикс -ов, а затем окончание -а, указывающее на женский род. Такой способ оформления фамилий типичен для народов Поволжья и Кавказа, где имена арабского происхождения адаптировали под русскую грамматику в XIX–XX веках. Суффикс -ов показывает, что фамилия возникла в среде, где фамилии давали по отцу: Музфаров буквально означает «сын Музфара».

В документах встречаются варианты написания: Музафаров, Музаффаров, Мозаффаров. Двойное «ф» в корне — признак более точной передачи арабского написания, но в повседневной записи оно часто упрощалось. В русских метрических книгах и советских паспортах закрепился вариант с одной «ф» — Музфаров.

Географически фамилия тяготеет к Татарстану, Башкортостану, а также к северокавказским республикам, особенно к Дагестану и Чечне. Встречается и у азербайджанцев. Социальный состав носителей разнороден: от крестьян до интеллигенции. Известных исторических деятелей с такой фамилией нет в широком доступе, что типично для фамилий, возникших в сельской среде и не попавших в дворянские родословные книги.

Отдельного внимания заслуживает ударение. В русском произношении оно обычно падает на последний слог — Музфаро́ва, хотя в языке-источнике ударным был второй слог: Музфа́р. Это обычная адаптация: русский язык «перетягивает» ударение на окончание в фамилиях с суффиксом -ов.