Фамилия Начаркин образована от мирского имени Начарка, которое восходит к марийскому слову «начар» - «плохой; слабый». В данном случае, надеясь иметь красивого и здорового мальчика, родители назвали его Начарка. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Начарка, со временем получил фамилию Начаркин.