Фамилия Надъярный — редкий пример фамилии, образованной от предлога и существительного. Её основа — «надъяр», где «яр» в древнерусском языке означал не только крутой обрыв или овраг, но и глубокий ров, а также место, где проводили народные собрания или судилища. Человек, которого прозвали Надъярным, мог жить на возвышенности над оврагом, на краю обрыва или за речным яром — то есть за крутым берегом. В говорах слово «яр» сохраняло и значение «глубокий овраг с водой», так что прозвище могло указывать на дом, стоящий прямо над обрывом.

Суффикс -н- в основе «надъярный» указывает на признак места: так называли того, кто находится «над яром». Формально фамилия относится к типу притяжательных прилагательных, но с характерным окончанием -ый, что типично для украинских и южнорусских фамилий. В русской традиции такие фамилии чаще оформлялись суффиксами -ов/-ев (Надъяров), поэтому вариант Надъярный — скорее южнорусский или украинский. В украинском языке «над» как приставка встречается часто, и «Над’ярний» могло бы означать «тот, кто живёт над яром».

Встречаемость фамилии крайне низкая. Она почти не фиксируется в массовых списках XIX века, что говорит о её локальном происхождении — скорее всего, из одного села или хутора, где прозвище закрепилось за целым родом. Возможна и вторая, менее вероятная версия: что «яр» здесь — не географический термин, а личное имя Яр (сокращение от Ярослав), и тогда Надъярный — «тот, кто над Яром», то есть старший или главный в роду. Но первая версия — с оврагом — правдоподобнее: в основе фамилий на -ярный почти всегда лежит рельеф, а не имя.