Фамилия Нагапетова — редкий случай, когда географическая привязка говорит о происхождении почти безошибочно. Это армянская фамилия, образованная по русской модели через суффикс -ов/-ев. В исконном виде она звучала бы как Нагапетян, но в документах Российской империи и советских загсах армянские фамилии часто русифицировали, заменяя окончание -ян на -ов или -ев.

В основе фамилии лежит армянское мужское имя Нагапет. В переводе с древнеармянского оно означает «новый вождь» или «новый предводитель» (от «ног» — новый, «пет» — глава, начальник). Это имя давали с пожеланием, чтобы мальчик стал лидером, зачинателем, первым в своём деле. В армянской ономастике имя Нагапет нередко встречается в исторических областях Западной Армении, а после геноцида 1915 года — в диаспоре и в регионах Юга России, куда переселились беженцы.

Если смотреть на словообразовательную модель, то фамилия Нагапетова — женская форма, мужская будет Нагапетов. Суффикс -ов в данном случае не указывает на принадлежность к русскому дворянству или крестьянству, а выполняет чисто грамматическую функцию адаптации иноязычной основы. Носитель фамилии в первом поколении, скорее всего, был сыном или внуком человека по имени Нагапет. Сословного оттенка у фамилии нет: её могли носить и ремесленники, и купцы, и крестьяне, в зависимости от того, в какой среде закрепилась русифицированная форма.

Интересная деталь: в отличие от массовых армянских фамилий на -ян, форма на -ов встречается чаще у тех семей, которые раньше других интегрировались в русскую административную систему — например, у казаков, мещан или государственных крестьян южных губерний. Так что предки Нагапетовых могли жить не в Закавказье, а на Кубани, Ставрополье или в Ростовской области, где армянские общины существовали с XVIII века.

Искать однокоренные фамилии среди русских не стоит: корень чисто армянский, и все варианты вроде Нагапетян, Нагапетов, Нагапетьянц — это разное оформление одного и того же имени-основы.