Фамилия Нахимзон — редкий пример, где отчётливо видна география и социальная среда возникновения. Это не русская фамилия в исконном смысле, а ашкеназская, сложившаяся на территории черты оседлости (современные Украина, Беларусь, Польша, Литва). Её основа — мужское личное имя Нахим, которое является формой библейского имени Нахум (в переводе с иврита — «утешитель»). В еврейской среде имя было распространённым, а в бытовой речи, особенно в идише, оно часто звучало именно как Нахим.

Модель образования проста: к основе Нахим- добавлен суффикс -зон. Это типичный для еврейских фамилий восточноевропейского происхождения патронимический суффикс, означающий «сын». То есть Нахимзон — буквально «сын Нахима». Аналогичную модель мы видим в фамилиях Абрамзон, Берзон, Гершзон. Если бы фамилия оформлялась по славянской модели, мы бы получили Нахимов или Нахимович. Выбор именно суффикса -зон указывает на то, что фамилия возникла в среде, где идиш и немецкая административная традиция (в канцеляриях Российской империи и Австро-Венгрии) смешивались, давая такие гибридные формы.

При этом важно не путать фамилию с русской фамилией Нахимов. Знаменитый адмирал Павел Нахимов носил фамилию, образованную от уменьшительной формы канонического имени Наум (Нахимка, Нахим). Несмотря на звуковое сходство, это совершенно разные фамилии с разной историей: одна — дворянская, другая — местечковая, патронимическая. Предки Нахимзонов, скорее всего, были простыми людьми — ремесленниками, торговцами, арендаторами, жившими в небольших городках и местечках. Фамилия не указывает на род занятий, а только на имя отца, что типично для фамилий, массово присвоенных еврейскому населению в конце XVIII — начале XIX века по указам о переписи.

В написании фамилии возможны варианты: Нахимзон, Нахемзон, Накхимзон. Твёрдое «з» и суффикс -он отличают её от более редкой формы Нахимсон (с английским суффиксом -son). Встречаемость фамилии невысока, она не входит в топ-1000 еврейских фамилий, но хорошо документирована в метрических книгах XIX века на территории Волынской, Подольской и Киевской губерний.