Фамилия Намятова — женская форма, а мужской вариант, Намятов, образован по самой распространённой в русском языке модели: от основы на твёрдый согласный с помощью суффикса -ов. Вопрос в том, что это за основа и откуда она взялась.

Самая вероятная версия связывает фамилию с диалектным словом «намят» или «намятый». В русских говорах «намятый» означало не просто «потрёпанный», а человека, которого «намняли бока» — побили, помяли. Такое прозвище мог получить тот, кто часто попадал в драки, либо, наоборот, неудачник, которого постоянно обижали. Слово «намятый» фиксируется в северных и сибирских говорах, что указывает на возможное географическое происхождение фамилии: предки Намятовых могли жить в Архангельской, Вологодской или Пермской губерниях.

Менее очевидная, но допустимая версия — отчество от нецерковного имени Намят. В дохристианской Руси существовали имена-обереги, данные по внешним признакам или событиям. Имя Намят могло быть дано ребёнку, которого «намяли» при родах, или, в переносном смысле, «запомнили» (от глагола «намятить» — запомнить, наметить). Однако глагол «намятить» редок и встречается в основном в южнорусских говорах, что создаёт противоречие с северной географией первой версии.

Фамилия редкая, её нет в списках массовых русских фамилий, что говорит о её локальном происхождении. Встречается она преимущественно в центральных и северных регионах России. В отличие от фамилий типа Наумов (от церковного имени Наум), Намятов не имеет отношения к святцам — это чисто прозвищная фамилия, отражающая бытовую, а не церковную традицию имянаречения.