Фамилия Нассоненко — характерный пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках стала доминирующей на Левобережной и Слободской Украине. Суффикс -енко исторически означал «маленький, сын того, кто назван в основе»: Нассоненко — буквально «сын Нассона». Вопрос в том, что скрывается за этим именем Нассон.

Самая вероятная версия — что Нассон — это народная, бытовая форма канонического имени Насон, которое восходит к библейскому имени Иона (евр. «голубь»). В украинской и белорусской традиции имя Иона часто переходило в формы Йона, Йонас, а затем — через упрощение и утрату начального гласного — в Насон. Нассон с двойной «с» могло возникнуть под влиянием графики или диалектного произношения, где согласный перед ударным гласным удлинялся. Таким образом, Нассоненко — это «потомок Насона», а сам Насон, скорее всего, был человеком, которого в церковных записях записывали как Иону, а в быту звали Насоном.

Менее вероятная, но возможная версия отталкивается от еврейского имени Нассон (Нахшон), известного по библейскому персонажу — предку царя Давида. Однако для украинской фамилии такая основа редка: суффиксальная модель -енко в еврейской среде почти не использовалась, а если и встречалась, то в более позднее время и в смешанных регионах. Поэтому версия с Ионой-Насоном выглядит гораздо органичнее для восточнославянской ономастики.

Географически фамилия Нассоненко тяготеет к центральным и восточным областям Украины — Полтавщине, Черкащине, Сумщине. В России она встречается редко и, как правило, у потомков переселенцев с Украины. Сословного барьера у фамилии не было: -енко носили и казаки, и крестьяне, и мещане. По переписям XVIII–XIX веков носители фамилии попадаются в реестрах казачьих полков, что указывает на возможную принадлежность к казачьему сословию, но утверждать это для каждой ветви нельзя.

Таким образом, Нассоненко — типичная украинская «сыновья» фамилия, образованная от разговорной формы имени Иона. Её редкость и двойное «с» в корне — не ошибка, а живое свидетельство того, как в устной речи имя меняло звучание, а потом закреплялось в документах именно в таком виде.