Фамилия Натальин образована от женского крестильного имени Наталья, которое в переводе с латинского означает «родимая, родная». В свою очередь имя Наталья является форма старинного редкого мужского имени Наталий, происходящего от латинского слова «наталис» — «родной», а также от латинского названия праздника рождества «диэс наталис» — «день рождества, рождения». В результате, потомок женщины, обладающей именем Наталья, со временем получил фамилию Натальин.