Фамилия Натапов относится к распространенному типу еврейских фамилий. Так, фамилия Натапов образована от еврейского мужского имени Натап, которое вероятно, восходит к слову «натаф», что значит «капля». В переносном значении натафом также называли благовонную смолу некого растения, вероятно, стиракса. Натаф использовался в иудаистских богослужениях. Все это свидетельствует о том, что фамилия Натапов представляет собой замечательный памятник европейской письменности и культуры. Однако процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения фамилии Натапов можно лишь на основании генеалогических исследований.