Фамилия Наташкин — редкий пример метронимической фамилии: её основой стало не имя отца, а женское имя. Восходит она к просторечной форме Наташка крестильного имени Наталья. Имя Наталья переводят с латыни как «родная», «родимая», а его далёкий первоисточник — латинское слово natalis («родной») и даже название праздника Рождества — dies natalis, то есть «день рождения». Любопытно, что у Натальи был и мужской аналог — редкое старинное имя Наталий, которое со временем вышло из употребления, оставив след в этой фамилии.

Метронимические фамилии на Руси появлялись реже отчественных, обычно в тех случаях, когда мать играла главную роль в семье — например, после её смерти или ухода отца, либо когда женщина была вдовой и сама вела хозяйство. Потомки такой женщины, носившей имя Наташка, со временем получали прозвание Наташкин, которое закрепилось как фамилия. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Наташкин, то есть сын или дочь Наташки.

Стоит отметить, что форма Наташка в старину не несла пренебрежительного оттенка, как сегодня. Это была обычная обиходная форма имени, которую использовали в быту наравне с полной. Поэтому фамилия Наташкин — не насмешливое прозвище, а уважительное указание на родство по материнской линии.

Встречается фамилия в разных вариантах: Наташкин, Наташкина, а также множественная форма Наташкины, характерная для северорусских и сибирских говоров, где фамилии на -их/-ых обозначали целый род или семью. Если человек носит фамилию Наташкины, это может указывать на семейное гнездо, где предков знали именно под этим именем.

Сегодня фамилия Наташкин не слишком распространена, но её носители есть в разных регионах России. Несмотря на кажущуюся простоту, за ней стоит пласт истории: и латинские корни имени, и особенности русской народной ономастики, и редкая для славян модель образования фамилии от женского имени. Это делает её ценным памятником языка и культуры, который сохранил память о женщине, давшей начало целому роду.