Фамилия Наушенко принадлежит к распространённому типу украинских и южнорусских фамилий, образованных от прозвищ с помощью суффикса -енко. Этот суффикс изначально означал «сын» или «потомок», то есть Наушенко — буквально «сын Науши». Само прозвище Науша, от которого пошла фамилия, в старину связывали с прилагательным «наушный» — то, что находится на ушах или служит для их покрытия. Так, наушниками называли пришитые к шапке боковые лопасти, защищавшие уши от стужи. Можно предположить, что основатель рода носил подобную шапку или повязку, и эта деталь внешности закрепилась за ним как прозвище.

Не исключено, что прозвище Науша относилось к «профессиональным» именованиям, указывающим на род занятий. В таком случае предок Наушенко мог быть портным, который шил головные уборы с наушниками. Однако есть и другая, более любопытная версия. В старину существовало слово «наушина» — так называли металлическую бляху на уши, то есть серьгу. Такие наушины первоначально носились на шлемах или даже на машинных снарядах, но со временем перешли в разряд украшений для человеческого уха. Если следовать этому значению, прозвище Науша получил человек, который носил серьги, — возможно, казак или воин, для которого такая деталь была не просто украшением, а знаком отличия.

Позже прозвище Науша, изначально присоединённое к наследственному имени, полностью заменило его как в повседневной жизни, так и в официальных документах. От этого прозвища и образовалась фамилия Наушенко. Интересно, что однокоренные фамилии — Наушкин, Наушников — встречаются реже и чаще фиксируются в северорусских говорах, тогда как форма с суффиксом -енко указывает на украинское или южнорусское происхождение рода. Это позволяет предположить, что предки Наушенко жили на территории современной Украины или в южных областях России, где подобная модель образования фамилий была особенно распространена.

Точных сведений о знаменитых носителях фамилии Наушенко в открытых источниках нет, что неудивительно: фамилия довольно редкая. Однако это не умаляет её ценности как исторического свидетельства. Сама по себе цепочка «Науша — Наушенко» показывает, как простое прозвище, данное по внешности или ремеслу, превратилось в наследственное родовое имя, пережившее столетия.