Фамилия Наушева — женская форма фамилии Наушев, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. В отличие от самых распространённых русских фамилий на -ов и -ин, здесь мы видим суффикс -ев, который указывает на принадлежность к отцу или главе семьи. Но есть тонкость: суффикс -ев обычно присоединяется к основам на мягкий согласный или на -й (как в фамилии Андреев от Андрей). Однако в фамилии Наушев основа заканчивается на шипящий -ш, который в древнерусском языке был мягким, поэтому написание через -ев исторически оправдано. Встречается и вариант Наушов, но он менее точен с точки зрения исторической фонетики.

Основа фамилии — Науш. Это могло быть прозвище или неканоническое имя. Самое прямое объяснение лежит на поверхности: «науш» — тот, кто наушничает, доносчик, ябеда. В русских говорах слово «наушить» означало «нашептать, наговорить, оклеветать». Прозвище Науш давали человеку, который любил сплетничать или доносить. Однако не стоит торопиться с негативной оценкой: в крестьянской среде прозвища часто давались по поведению без злого умысла, просто как меткая характеристика.

Есть и другая, менее очевидная версия. В некоторых диалектах «науш» могло означать «наушник» — часть головного убора, которая закрывает уши. В этом случае прозвище мог получить человек, носивший характерную шапку с опущенными ушами, или, напротив, тот, у кого были заметные, оттопыренные уши. Такие прозвища по внешним признакам — одни из древнейших.

Географически фамилия Наушев и Наушева встречается не повсеместно, а сконцентрирована в Поволжье, особенно в Самарской и Оренбургской областях. Это наводит на мысль, что фамилия могла возникнуть в среде переселенцев из центральной России. Среди татар и башкир встречается похожая фамилия Наушев, но там она может восходить к тюркскому личному имени Науш (от арабского «науш» — сладкий, приятный). Для русской фамилии тюркская версия менее вероятна, но полностью исключать её нельзя, учитывая многовековое соседство народов.

Сословно фамилия Наушева не несёт следов дворянского происхождения — она типично крестьянская или мещанская. Известных исторических деятелей с такой фамилией нет, что для рядовой русской фамилии скорее норма, чем исключение. Фамилия не редкая, но и не массовая: её носители живут в основном в тех же регионах, где она и возникла, что говорит о слабой миграции предков.