Фамилия Наволочкина — женская форма фамилии Наволочкин, и её происхождение напрямую связано с бытовым прозвищем или профессией предка. Основа фамилии — слово «наволочка» (чехол для подушки), но это не единственная версия. В русских говорах «наволока» могла означать не только постельную принадлежность, но и «наносную землю», «намывной берег», а также «покрывало» или «верхнюю одежду». Однако для фамилии вероятнее прозвище, данное человеку, который шил наволочки или торговал ими, — то есть ремесленное имя по продукту труда.

Суффикс -ин в фамилии Наволочкин указывает на принадлежность: «чей?» — Наволочкиных. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от слов женского рода с окончанием -а. Если бы основа была мужского рода, мы бы увидели суффикс -ов (например, Наволочков). Это тонкое различие, но оно помогает понять, что прозвище Наволочка дали именно мужчине, а не женщине: в древнерусской антропонимии мужчина мог получить прозвище по предмету женского рода, и фамилия закрепилась в форме Наволочкин.

Региональная привязка фамилии слабая, но в переписных книгах XVII–XVIII веков встречаются крестьяне с прозвищем Наволока на Русском Севере и в Поволжье. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные образования (Тряпичкин, Свечкин) объясняются именно профессиональной основой. Альтернативная версия — происхождение от географического названия: в Архангельской области есть деревня Наволок, а житель такого места мог получить прозвище Наволочный. Но для фамилии Наволочкин эта версия менее убедительна, так как суффикс -ин редко образует фамилии от топонимов на -ок.

Фамилия редкая, не дворянская. Сословно её носители — скорее всего, крестьяне или посадские люди, занимавшиеся шитьём или торговлей домашним текстилем. В современном русском языке фамилия не теряет связи с бытовым словом «наволочка», что делает её прозрачной для восприятия, хотя первоначальное прозвище могло быть более узким — например, относиться к человеку, который постоянно возился с подушками или спал на необычной наволочке.