Прозвище Найдун восходит к украинскому слову «найда» - «ребенок-подкидыш, найденный и взятый кем-нибудь на воспитание». Менее вероятно, что фамилия Найдунов восходит к мирскому имени Найдун. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Найдун, со временем получил фамилию Найдунов.