Фамилия Негорин — один из тех случаев, когда внешне простая основа таит в себе несколько возможных, и очень разных, историй. Главная сложность в том, что корень «негор-» не встречается в древнерусских именах или названиях ремёсел напрямую, поэтому этимологу приходится выбирать между прозвищем, искажённым именем или географическим названием.

Самый очевидный путь — через прозвище Негора. В русских говорах слово «негора» могло означать «неудачник», «тот, кому не везёт», или, напротив, «не сгорающий», «живучий» человек. Контекст решал всё: в одном случае так могли назвать человека, который избежал пожара или беды, в другом — с горькой иронией того, у кого «всё валится из рук». Фамилии на -ин образуются от основ на -а/-я, поэтому Негорин — буквально «чей-то сын» или «человек из рода Негоры».

Вторая версия выводит фамилию из крестильного имени. В старину бытовало редкое имя Негор (сокращение от Нестор или, возможно, от Егор через отрицательную приставку). Церковное имя Нестор в народной речи могло редуцироваться до Негор, а уже от него пошла фамилия. Это объяснение менее вероятно, потому что форма «Негор» для Нестора не характерна, но полностью исключать её нельзя.

Третья, менее распространённая гипотеза — связь с топонимом. В России существуют небольшие речки и урочища с названием Негора, Негорка. Если предки Негориных жили на берегу такой речки или в деревне с похожим именем, фамилия могла закрепиться по месту жительства: «Негорин» — «выходец с Негоры». Однако суффикс -ин в таких случаях обычно указывает на принадлежность к конкретному лицу, а не к месту, поэтому эта версия слабее прозвищной.

По суффиксу фамилия типична для центральных и северных областей России. Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении: скорее всего, родоначальник Негориных жил в одной местности, и фамилия не получила широкого распространения. Сведений о дворянских корнях или принадлежности к известным сословиям нет — перед нами, вероятно, крестьянская или мещанская фамилия, образованная от бытового прозвища.