Фамилия Негусева — женская форма фамилии Негусев, и в основе её лежит прозвище или мирское имя. Разбирать её стоит с неочевидной стороны: с суффикса -ев, который указывает на происхождение от отчества или прозвища, оканчивающегося на согласный или -й. В данном случае корень «Негус» — наиболее интересная часть, вызывающая несколько версий.

Самая прямая и правдоподобная версия связывает фамилию с диалектным словом «негус» или «негусь». В русских говорах, особенно северных и сибирских, «негус» могли называть нелюдимого, угрюмого или медлительного человека. Слово образовано от «не» и «гусь» — вероятно, по аналогии с поведением этой птицы: гусь может шипеть, быть агрессивным или, наоборот, медлительным. Прозвище Негус закреплялось за человеком с таким характером, а его дети становились Негусевыми. В пользу этой версии говорит и то, что фамилия встречается в основном в центральных и северных областях России, где подобные прозвища были распространены.

Вторая, более редкая версия — связь с библейским или историческим именем. В Эфиопии титул «негус» означает «царь» или «правитель». Однако для русского крестьянского или посадского населения XVI–XVII веков это маловероятный источник: заимствование из амхарского языка в бытовую среду практически исключено. Если бы фамилия была семинарской (искусственной, данной в духовных училищах), она скорее имела бы окончание -ский. Поэтому версия с эфиопским корнем — натяжка, и её стоит отбросить.

Словообразовательная модель проста: основа «Негус» + патронимический суффикс -ев. Это типичный для русских фамилий способ: так образовывали отчества от прозвищ или имён, оканчивающихся на твёрдый согласный. В отличие от фамилий на -ин (от основ на -а/-я), здесь суффикс -ев указывает на мужскую форму прозвища.

Географически фамилия Негусева (и Негусев) фиксируется в основном в Тверской, Ярославской и Вологодской областях — регионах, где сохранялись архаичные говоры и прозвищные традиции. Это косвенно подтверждает диалектную природу корня.

Таким образом, предок носителей фамилии Негусев, скорее всего, получил прозвище Негус за свой замкнутый или необщительный нрав. Фамилия не относится к числу знатных или распространённых, но несёт в себе живую черту характера, которую подметили односельчане несколько столетий назад.