Фамилия Неклесо — редкий случай, когда прозвище сохранилось в чистом виде, без суффиксов -ов, -ев или -ин. Это так называемая «окаменевшая» форма имени или прозвища, которая закрепилась в качестве фамилии в южнорусских и украинских говорах. В русской ономастике такие фамилии встречаются реже, чем модели с патронимическими суффиксами, и часто указывают на более позднее оформление или на происхождение из среды, где фамилии складывались не по великорусскому образцу.

Основа фамилии — глагол «неклесить». В диалектах (прежде всего курских, орловских, воронежских) «клесить» означало «плести, сбивать, путать», а также «говорить вздор, врать». Соответственно, «неклесо» — это человек, который не плетёт, не путает, то есть говорит прямо, ясно и толково. Вполне вероятно, что прозвище Неклесо давали человеку рассудительному, с чёткой речью, который не «несёт околесицу». Есть и вторая, менее распространённая версия: от «клесать» — «резать, сечь», и тогда «неклесо» могло означать «неумелый, неловкий в работе», но первое толкование выглядит логичнее, поскольку в говорах «клесить» устойчиво связано с речью и путаницей.

Словообразовательно фамилия стоит особняком: окончание -о не типично для русских фамилий, но характерно для украинских прозвищных фамилий (Бойко, Недайвода, Завалишина). Учитывая ареал бытования — юг России и Украина, — можно предположить, что предок носителя фамилии был выходцем из этих земель, и его прозвище записали в документах без добавления суффикса, что иногда случалось при переписях в слободских и малороссийских губерниях. В сословном отношении это, скорее всего, крестьянская или казацкая фамилия, без дворянских корней.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Клесов, Клесин, Клесовский — подтверждает, что основа «клес» продуктивна, но только в фамилии Неклесо мы видим отрицание, превратившее характеристику в имя. Это делает фамилию не просто редкой, но и выразительной: она прямо сообщает о качестве человека, а не о его отце или занятии.