Фамилия Неклесов образована от личного прозвища Неклес и относится к распространенному типу русских фамилий, построенных по модели «прозвище + суффикс -ов». Суффикс здесь указывает на принадлежность: Неклесов — это сын, потомок Неклеса. Основа фамилии — редкая, и именно из-за редкости корня вокруг неё возникло несколько версий толкования.

Скорее всего, прозвище Неклес восходит к глаголу «клесать» — «ущемлять, сжимать, тискать, сдавливать» — с отрицательной частицей «не». В этом случае Неклесом могли называть мягкого, добродушного или слабого человека, того, кто не способен «сжать», настоять на своём, дать отпор. Такая модель прозвищ — с частицей «не» — типична для русской антропонимии: Некрас (некрасивый), Неждан (нежданный), Немир. Эти имена и прозвища не несли оскорбления, а служили оберегом или просто фиксировали заметную черту характера.

Согласно другой гипотезе, в основе фамилии лежит глагол «клескать» — «плескать», «хлопать, хлестать», а также «браниться» или «скупо торговаться». В диалектах этот глагол имел разные оттенки, и прозвище Неклес могло получить человек, который не бранился, не хлопал дверями или, наоборот, не умел торговаться. Однако и в этом случае прозвище указывает на характер человека, а не на род занятий. Первая версия выглядит правдоподобнее: она проще и опирается на более распространённое значение корня.

Стоит обратить внимание на само слово «клесать». Оно относится к пласту диалектной лексики, которая редко попадала в литературный язык, но активно использовалась в народной речи. Фамилии, образованные от таких слов, — ценный материал для историков языка: они сохранили то, что не вошло в словари. Прозвище Неклес, каким бы оно ни было по значению, звучало живо и выразительно, а потому закрепилось за человеком и перешло к его детям.

Потомок человека по прозвищу Неклес со временем получил фамилию Неклесов. О точном месте и времени её возникновения говорить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, с XV по XVII век, и шёл неравномерно в разных землях. Сначала фамилии закрепились у знати, затем у посадских людей и крестьян. Фамилия Неклесов, судя по простоте модели и диалектной основе, скорее всего, возникла в крестьянской или посадской среде, но документальных подтверждений этому нет.

Редкость фамилии делает её особенно интересной для носителей: в отличие от массовых Ивановых или Кузнецовых, Неклесовы почти наверняка происходят из одной локальной ветви, и каждый носитель этой фамилии может иметь общих предков с другими Неклесовыми. Фамилия Неклесов — замечательный памятник славянской письменности и культуры, сохранивший в себе редкое диалектное слово и народную манеру давать прозвища по характеру.