Фамилия Некрушев — одна из тех, где на слух угадывается отрицание, но за ним стоит не прозвище, а имя. Основа здесь — «Некруш», и это, скорее всего, сокращение от крестильного имени Некруш, которое в свою очередь восходит к древнееврейскому Нехемия (в русской традиции — Неемия). Такая модель образования фамилий из разговорных форм канонических имён — обычное дело на Руси: имя укорачивали, добавляли суффикс принадлежности, и получалась фамилия. Суффикс -ев указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий согласный или шипящий (Некруш → Некрушев), и это типично для центральных и южнорусских говоров.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с украинским или белорусским диалектным словом «некруш» — так могли назвать некрушимое, крепкое, упрямое дитя. Однако в этом случае прозвище должно было бы звучать как «Некруш» в значении «тот, кого не сломать», но такая лексика встречается редко и не зафиксирована в авторитетных ономастических словарях как основа для фамилий. Поэтому версия с именем Неемия выглядит убедительнее.

Географически фамилия Некрушев нешироко распространена, но её корни уходят в южные регионы России и восток Украины. Встречается она и у потомков казачества, где подобные фамилии на -ев были обычны. Интересная деталь: в старых переписях можно найти написание «Некрушов» — с твёрдым окончанием, что говорит о колебании в произношении и записи фамилии в XIX веке. Это ещё раз подтверждает, что фамилия формировалась в живой устной среде, а не по строгой канцелярской норме.

Таким образом, предки Некрушевых, скорее всего, были крестьянами или казаками, а сама фамилия — следствием того, что в быту человека звали не полным церковным именем, а его домашним, сокращённым вариантом. Никакой тайны или тёмного смысла в ней нет — просто имя, обросшее суффиксом.