Фамилия Непопоа — редкий случай в русской ономастике, и её происхождение почти наверняка не славянское. Если отбросить маловероятные версии о случайном искажении при переписи (вроде «Не попал» или «Непопов»), то наиболее правдоподобное объяснение лежит в географии и языке народов Кавказа или Поволжья. Фамилия оканчивается на -а, что типично для многих фамилий грузинского, абхазского, а также тюркского происхождения (например, чувашских или татарских), где ударение часто падает на последний слог.

Основа «Непопо» может восходить к личному имени или прозвищу. В некоторых тюркских языках, в частности в чувашском, «непоп» или близкие по звучанию слова могут означать что-то вроде «нежный», «мягкий» или быть вариантом имени с уменьшительным суффиксом. В абхазском языке существует фамилия Непоп (Нәаҧаа), и добавление финального -а в русской записи могло закрепиться как типичное окончание при русификации (сравните: Ардзинба, Лакоба). Таким образом, Непопоа — это, скорее всего, адаптированная к русскому языку фамилия, корни которой ведут к предку, носившему имя или прозвище Непоп.

Словообразовательная модель здесь проста: основа Непопо + окончание -а. Суффиксы -ов/-ев или -ин, характерные для исконно русских фамилий, отсутствуют. Это прямо указывает на то, что фамилия не образовывалась по стандартной схеме «сын такого-то», а была заимствована как готовая форма из другого языка. С точки зрения сословной принадлежности, предки носителя фамилии могли относиться к крестьянству или дворянству (на Кавказе фамилии часто носили и князья, и простые горцы), но без конкретных генеалогических записей сказать точнее невозможно.

Географически фамилия Непопоа встречается крайне редко, и её следы скорее всего ведут в регионы компактного проживания абхазов или чувашей, где подобные антропонимы не редкость. Если вы встретили эту фамилию у человека из Абхазии или Чувашии, версия с местным происхождением становится почти очевидной. В иных случаях стоит проверить, не является ли написание результатом ошибки в документах (например, вместо «Непопов» или «Непопа»).