Фамилия Неприна — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не профессия и не географическое название, а слово с яркой эмоциональной окраской. Она образована по самой распространённой в русской ономастике модели — с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Неприн, то есть сын или потомок Непри. Так называли человека, который получил прозвище Непра.

Корень здесь — древнерусское слово «непра», то есть «неправедный», «неправый», «виноватый». В старину прозвище Непра могли дать тому, кто часто нарушал порядок, спорил с правдой или просто был неуживчив. Но не стоит спешить с выводами: в крестьянской среде такие прозвища нередко закреплялись в ироничном, «обережном» смысле. Родители могли назвать ребёнка Непром, чтобы отвести от него настоящую беду — считалось, что «плохое» имя отпугивает злые силы. Так что предок Неприных мог быть и вполне благочестивым человеком, просто носившим защитное прозвище.

Встречается версия, что фамилия связана с гидронимом Непр — старым названием Днепра (в летописях — «Непръ»). Однако словообразовательная цепочка «Непр → Неприн → Неприна» выглядит натянутой: от названия реки обычно образовывали фамилии через суффикс -ский (Непринский) или -ов (Непров). Прямая связь с прозвищем Непра гораздо логичнее.

Фамилия Неприна — женская форма, указывающая на замужнюю женщину или дочь из рода Неприных. Мужской вариант — Неприн. Встречается она редко, в основном в центральных и южных областях России. По данным переписей XIX века, Неприны чаще всего числились государственными крестьянами — то есть лично свободными, но приписанными к казённой земле. Никаких дворянских ветвей или громких исторических имён за этой фамилией не числится, что только подчёркивает её народное, корневое происхождение.