Фамилия Нейковчена — редкий случай, когда географический суффикс и основа слились в одно слово, а сама фамилия почти не встречается за пределами узкого ареала. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать её не по привычной схеме «корень + суффикс + окончание», а как сложное образование, где каждая часть несёт чёткую информацию о месте.

Первое, что бросается в глаза, — суффикс -чен- в сочетании с окончанием -а. В русской ономастике это характерно для фамилий, образованных от названий сёл или деревень через притяжательное прилагательное, которое затем субстантивировалось. Например, фамилии типа Козловченко или Иващенко указывают на выходца из конкретного поселения. В случае Нейковчена основа Нейков- скорее всего восходит к топониму Нейково или Нейковка. Такие названия в России и на Украине встречаются редко, но известны: есть село Нейково в бывшей Самарской губернии (основано немецкими колонистами, от немецкого Neu — «новый»), а также хутора с похожими именами в южных регионах.

Если это так, то фамилия Нейковчена буквально означает «та, что из Нейкова» или «женщина, принадлежащая к роду из Нейкова». Окончание -а указывает на женскую форму, что нетипично для русских фамилий — обычно они застывают в мужском роде. Это наводит на мысль, что фамилия могла возникнуть в среде, где сохранялась живая система прозвищ по месту жительства, например, в украинском или южнорусском диалектном окружении. Либо перед нами редкий случай патронимической фамилии, где суффикс -чен- (уменьшительный от -ко) образует форму «сын Нейка» — то есть основа Нейко могла быть прозвищем или именем, а Нейковчен — уже «внук» или «потомок». Но тогда окончание -а сбивает: логичнее было бы Нейковченко.

Есть и третья, менее вероятная версия: связь с болгарским или македонским антропонимиконом, где суффикс -чена встречается в женских фамилиях (например, Иванова-Чена). Однако без документальных подтверждений эта гипотеза остаётся спекулятивной.

Самое правдоподобное объяснение — фамилия образована от названия населённого пункта Нейково с помощью суффикса -чен- и окончания -а, что указывает на принадлежность к этому месту. Носители фамилии, скорее всего, были выходцами из одного села или хутора, а сама фамилия закрепилась в женской форме либо из-за особенностей местного говора, либо из-за ошибки при записи в документах. В любом случае, Нейковчена — это редкий топонимический след, который почти не имеет однокоренных родственников в современных фамильных списках.