Фамилия Нежильский — яркий пример того, как отрицательная частица в основе может ввести в заблуждение. Вопреки первому впечатлению, она не имеет отношения к слову «нежить» или чему-то потустороннему. Её значение лежит в бытовой, вполне земной плоскости.

Корень здесь — «жил-» (от «жило», «жильё»), а приставка «не-» выполняет роль отрицания. Суффикс «-ский» указывает на типичную польскую или западнорусскую модель образования фамилий по названию местности. Скорее всего, Нежильский — это человек, который получил фамилию от географического названия вроде Нежилье, Нежиль, Нежильск. Такие топонимы могли возникнуть в местах, где люди селились на «нежилой», то есть пустующей, необжитой земле, или, наоборот, в заброшенном, давно покинутом жителями поселении. Прозвище «Нежилой» могли дать и человеку, который жил на отшибе, в глухом месте.

Вторая, менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с профессиональным прозвищем. В некоторых говорах «нежиль» могло означать нечто непрочное, временное, например, лёгкую постройку или шалаш. Тогда Нежильский — строитель или владелец такого временного жилья. Однако первая, топонимическая, гипотеза выглядит убедительнее, особенно если учесть, что фамилия распространена преимущественно на западе России, в Беларуси и на Украине — в зоне активного взаимодействия польской и восточнославянской ономастики.

Фамилия редкая, не входит в сотни самых частотных. Её носители — это, скорее всего, потомки мелкой шляхты или крестьян, получивших фамилию по месту выхода. Сравните с однокоренными, но более прозрачными фамилиями Жилинский, Жильцов — здесь механизм тот же, но с другим знаком.