Фамилия Нежнева образована от прозвища Нежень, которое восходит к аналогичному существительному, имеющему значение «изнеженный человек». Вероятно, таким прозвищем нарекли изнеженного, избалованного, хрупкого человека. Согласно другой версии, прозвище Нежень получил ласковый, приятный в общении, манерный, воспитанный мужчина. Таким образом, прозвище Нежень могло указывать на особенности характера родоначальника Нежневых. Существует другая, менее правдоподобная гипотеза, по которой прозвище Нежень восходит к топониму Нежен. Возможно, что предок Нежневых был выходцем из этого города.