Фамилия Никитишын — редкий пример того, как русская модель образования фамилий встретилась с украинской или белорусской фонетикой. На первый взгляд она кажется обычным отчеством от имени Никита, но суффикс -ышын выбивается из стандартного ряда.

В великорусской традиции фамилии от имени Никита образовывались с суффиксом -ин: Никитин. Форма Никитишын построена иначе: к основе Никитиш- (где -иш- — увеличительный или пренебрежительный суффикс, как в словах «домище», «ручища») добавляется притяжательный суффикс -ын. Получается буквально «сын того, кого звали Никитиш», то есть «сын Большого Никиты» или «сын Никитища». Такая модель характерна для украинских и южнорусских говоров, где суффикс -ищ- мог превращаться в -иш- под влиянием местного произношения.

Есть и более прозаичная версия: фамилия могла возникнуть из-за особенностей диалектного произношения. В некоторых регионах (например, в Курской или Воронежской губерниях) окончание -ин после шипящих и мягких согласных звучало как -ын. То есть Никитишын — это просто фонетический вариант фамилии Никитишин, которая, в свою очередь, восходит к тому же Никите через уменьшительно-ласкательную форму Никитиш (аналог Никитка, но с другим суффиксом). Сравните с фамилиями Ильишын, Фомишын — они встречаются в тех же областях.

Сословно носители фамилии Никитишын, скорее всего, относились к крестьянам или мещанам. Фамилии с такими редкими суффиксами редко встречаются у дворянства, которое предпочитало стандартные -ов и -ин. Географически фамилия привязана к западу и югу России, а также к востоку Украины, где смешение языковых традиций давало подобные словообразовательные гибриды. В современных телефонных справочниках и базах данных Никитишын встречается единично — это фамилия, которую не «исправили» при переписях на более привычную Никитин, и она сохранила живое диалектное звучание.