Фамилия Нистрян — редкий случай в русском ономастиконе. Её происхождение почти наверняка не славянское, а румынское или молдавское. Ключ к разгадке — географическое название. Основа «Нистр-» восходит к гидрониму Днестр: в румынском языке река называется Nistru. Суффикс «-ян» — типичный для молдавских и румынских фамилий, указывающий на принадлежность к местности или роду (сравните с фамилиями Должан, Бужорян). Таким образом, Нистрян — это «днестровец», то есть человек, живший на берегах Днестра или выходец оттуда.

В русской среде фамилия могла появиться двумя путями. Первый — через переселение молдаван или украинцев из Приднестровья, Бессарабии или Буковины. Второй — через «обрусение» исходной формы: в документах XIX века молдавскую фамилию Nistreanu могли записать как Нистрян, отбросив окончание «-у». Обратите внимание, что окончание «-ян» здесь не является русским патронимическим суффиксом (как в фамилиях Петрян, Иван), а служит этническим или топонимическим маркером.

Словообразовательная модель проста: корень «Нистр-» + суффикс «-ян». Ударение, скорее всего, падает на последний слог — Нистря́н, что свойственно румынским заимствованиям. Фамилия практически не встречается в центральных и северных областях России, её ареал — юго-западные регионы, Краснодарский край, Ростовская область, а также Молдова и Приднестровье. В дореволюционных метрических книгах её можно найти среди мещан и крестьян, но не в дворянских родословных. Сословной привязки нет: носителями были как земледельцы, так и горожане. Других версий происхождения, кроме топонимической, не существует — попытки связать фамилию с греческим «нист» или тюркскими корнями лишены лингвистических оснований.