Фамилия Ниякина — женская форма фамилии Ниякин, и её происхождение почти наверняка связано с географическим названием. В русской ономастической традиции суффикс -ин указывает на принадлежность, чаще всего по отцу или по местности. Основа «Нияк-» в русском языке не имеет очевидного лексического значения, не встречается в словарях нарицательных слов. Это заставляет искать корни в топонимике.

Наиболее вероятная версия — происхождение от названия реки Нияк. Такая река существует в Пермском крае, в Коми-Пермяцком округе. Она является левым притоком реки Косы. В таком случае фамилия Ниякин могла возникнуть как прозвище или именование человека, жившего на этой реке или пришедшего с её берегов. Подобная модель образования фамилий от гидронимов (названий рек) очень распространена в северных и уральских регионах России: вспомним фамилии Печорин, Волгин, Иртышов.

Суффикс -ин в данном случае работает по той же схеме, что и в фамилиях Москвин (от Москвы-реки) или Камышин. То есть Ниякин — это «человек с Нияка». Женская форма Ниякина, соответственно, означает «жена или дочь Ниякина».

Менее вероятна, но допустима версия о происхождении от прозвища, связанного с диалектным словом. В некоторых говорах могло бытовать слово «нияк» (возможно, искажённое «няк» — что-то мягкое, вязкое, или даже от «нянька»), но убедительных следов такого прозвища в исторических документах нет. Поэтому версия с рекой Нияк остаётся основной и самой логичной.

Таким образом, носительница фамилии Ниякина может с большой долей вероятности связать свою родословную с Уралом или Прикамьем, а её предки, скорее всего, были крестьянами или промышленными людьми, жившими у реки Нияк. Фамилия редкая, что только подтверждает её локальное, а не общерусское происхождение.