Фамилия Ногачева — женская форма, в мужском варианте звучит как Ногачев. Её основа — прозвище или нецерковное имя Ногач. В русских говорах «ногач» — это либо человек с большими или длинными ногами (по аналогии с «рукач», «усач»), либо, что правдоподобнее, работник, занятый ручной ножной работой: например, тот, кто топтал глину или мял кожу ногами. В словаре Даля «ногач» — ещё и большой жук с длинными ногами, но вряд ли прозвище давали по жуку — скорее по внешности или профессии.

Суффикс -ев указывает на притяжательное значение: Ногачев буквально означает «сын Ногача» или «принадлежащий Ногачу». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ, оканчивающихся на шипящий или мягкий согласный. Интересно, что фамилия Ногачев встречается и в украинской, и в белорусской среде, где «ногач» могло означать то же самое, но с местными диалектными оттенками.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с топонимом Ногачи (название нескольких деревень в России, например в Тверской области). Тогда фамилия могла возникнуть у выходца из такого села. Однако в ономастике чаще прозвищная основа первична, чем географическая.

По сословному составу носители Ногачевых встречаются и среди крестьян (особенно в южнорусских и центральных губерниях), и среди казачества — например, на Дону. В казачьей среде прозвища по физическим особенностям были распространены, и фамилия закрепилась рано: уже в XVII веке в документах упоминаются донские казаки Ногачевы.

Фамилия не относится к числу редких, но и не массовая. Её однокоренные «родственники» — Ногин, Ножкин, Ногаев — все от той же основы «нога», но с разными суффиксами, что показывает, насколько разнообразно русское прозвищное словообразование.