Фамилия Ноганов — наглядный пример того, как русская модель образования фамилий «накладывается» на нерусскую основу. Вопреки первому впечатлению, корень здесь не «нога» (от слова «нога»), а тюркское личное имя Ноган.

В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) слово «ноган» означает «свет», «сияние», «луна». Это было распространённое мужское имя, которое давали ребёнку с пожеланием, чтобы он был светлым, ясным, красивым, как луна. Упоминание луны в имени — типичный мотив для восточной антропонимии, где часто использовали небесные светила как символ чистоты и благополучия.

Фамилию образовали по стандартной русской модели: к основе Ноган прибавили патронимический суффикс -ов, который буквально отвечает на вопрос «чей?» — сын Ногана. Так в русских документах, при переписях и в метрических книгах фиксировали детей и внуков человека по имени Ноган. То есть первый носитель фамилии Ноганов был, скорее всего, сыном или потомком татарина, башкира или другого тюркоязычного человека по имени Ноган.

Встречается фамилия преимущественно в Поволжье, на Урале и в Западной Сибири — в регионах, где исторически жили татары и башкиры, а в XIX–XX веках происходила активная русификация фамилий. Носителей фамилии можно найти как среди русских, так и среди татар, башкир, чувашей — в зависимости от того, как семья записалась при переходе в православие или при паспортизации.

Важно не путать фамилию Ноганов с фамилиями, образованными от прозвища Нога (например, Ногин). В случае с Ногановым корень однозначно указывает на имя, а не на часть тела. Редкая версия, что фамилия могла произойти от прозвища «Ноган» (например, человека, который ходил босиком или имел особенность походки), маловероятна: в русских говорах такого прозвища не зафиксировано, а тюркское имя Ноган — хорошо документировано.