Фамилия Новожени — редкий пример русской фамилии, образованной не по стандартной модели с суффиксом, а с помощью окончания, которое может сбить с толку. На слух она напоминает фамилии на -ин (Пушкин, Гагарин), но на деле это форма родительного или предложного падежа множественного числа. Проще говоря, Новожени — это «из семьи Новоженов» или «от Новоженов». В русской ономастике такие фамилии встречаются у выходцев из северных и сибирских регионов, где была распространена модель на -их/-ых (Седых, Черных), но Новожени стоит особняком: здесь окончание -и при мужской основе.

Корень фамилии — «новожен» или «новожёна». В старорусском языке так называли молодожёна, человека, который недавно женился. Слово «новожён» (с ударением на последний слог) фиксируется в диалектах и документах XVI–XVII веков. Прозвище Новоженя могли дать недавно женившемуся парню, а со временем оно закрепилось за его потомками. В отличие от фамилий типа Новожёнов, где суффикс -ов указывает на принадлежность («сын Новожёна»), окончание -и в Новожени подчёркивает коллективную принадлежность: «из рода Новоженей». Это характерно для фамилий, которые записывались в церковных метриках как «такой-то Новожени» — то есть из семьи, где главу звали Новожен.

Географически фамилия встречается в основном на Русском Севере и в Поволжье, особенно в Архангельской и Вологодской областях. Там же бытует вариант Новожёнов, но Новожени — более архаичная форма, сохранившаяся в старых крестьянских родах. Социальный контекст простой: предки носителей фамилии были, скорее всего, крестьянами или посадскими людьми. Никакого дворянства или боярских корней здесь нет — прозвище бытовое, живое, данное по семейному положению.

Филолог Б. Унбегаун в «Русских фамилиях» упоминает подобные модели на -и как редкие и преимущественно северные. Если сопоставить Новожени с однокоренными фамилиями (Новоженов, Новожен, Новоженя), становится ясно: это не искажение и не ошибка писаря, а сознательное использование падежной формы для обозначения «тех самых Новоженей». Так что фамилия говорит о предке, который в своё время был просто «новожёном» — молодым мужем, и это прозвище оказалось настолько цепким, что пережило века.