Фамилия Нуштайкина — женская форма фамилии Нуштайкин, которая образована по самой распространённой в русском языке модели: от прозвища или имени с помощью суффикса -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Нуштайкин буквально означает «сын Нуштайки» или «человек из рода Нуштайки». Мужская фамилия Нуштайкин, в свою очередь, произошла от прозвища Нуштайка.

С корнем здесь сложнее. В русском языке нет общеупотребительного слова «нуштайка». Скорее всего, это диалектное или профессиональное прозвище. Первая версия: основа «нуш-» может быть связана с глаголом «нужать» (нудить, заставлять, принуждать) или с диалектным «нужный» в значении «бедный, нуждающийся». В таком случае Нуштайкой могли прозвать человека прижимистого или, наоборот, того, кто постоянно нуждался. Вторая версия, более редкая, предполагает иноязычное происхождение. В тюркских языках есть слова с корнем «нуш» (сладкий, приятный, или часть имени Нушарван). Если носители фамилии жили в Поволжье или на Урале, где столетиями шло смешение с татарами и башкирами, прозвище могло быть заимствованным и переосмысленным. Третья, самая простая версия: прозвище от некалендарного имени или даже от глагола «нушкать» (нянчить, качать) — Нуштайкой могли назвать младшего ребёнка или того, кто качал люльку.

Географически фамилия редкая. Основные следы ведут в центральные и северные области России, а также в Пермский край. Сословно, скорее всего, это крестьянская фамилия, поскольку суффикс -ин и прозвищная основа характерны для непривилегированных слоёв населения. Фамилия не встречается в старых дворянских родословных книгах.

Особенность написания — окончание -айкин. Это указывает на то, что исходное прозвище было образовано с помощью уменьшительно-ласкательного суффикса -айк(а), что типично для русских обиходных имён (Михайка, Ивашка, Нуштайка). Таким образом, Нуштайкина — это «дочь или жена того, кого звали Нуштайкой», и корень этого прозвища теряется в местных говорах или заимствованиях, но точно не связан с чем-то книжным или официальным.