Фамилия Обеленис — редкий случай в русском ономастиконе. Её окончание -ис сразу выбивается из привычного ряда русских фамильных суффиксов (-ов, -ев, -ин, -ский). Такое оформление почти всегда указывает на литовское происхождение. Это фамилия, которая попала в русскую среду из балтийских земель, скорее всего, из Литвы, где фамилии на -ис — норма, а не исключение. В русском языке их часто русифицировали, но Обеленис сохранила исходное звучание.

Основа фамилии — Обелен-. В литовском языке существует слово obelis — «яблоня». Фамилия Обеленис, вероятнее всего, образована от него с помощью суффикса -енис, который в балтийской антропонимии указывает на отношение к чему-то или происхождение. То есть Обеленис — это «яблоневый» или «тот, кто связан с яблоней». Прозвище могли дать человеку, жившему в яблоневом саду, владельцу яблоневых угодий или даже садоводу.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с литовским obelė («яблочко») или с фамилией Obelenis, которая могла возникнуть как прозвище по внешнему признаку: круглолицый или румяный, как яблоко. Однако садоводческая версия выглядит надёжнее: в доиндустриальной Литве фамилии, образованные от названий деревьев и растений, были распространены среди крестьян и мелких землевладельцев.

В русских архивах фамилия Обеленис встречается эпизодически, преимущественно в западных губерниях Российской империи — Ковенской, Виленской, Сувалкской. Носители фамилии, скорее всего, были литовцами или полонизированными литовцами, которые переезжали вглубь России в XIX–XX веках. Никаких данных о дворянском происхождении или принадлежности к известному роду нет — это фамилия простого сельского корня.

Таким образом, Обеленис — не русская фамилия по происхождению, а литовская, закрепившаяся в русском быту без переделки. Её значение прозрачно: она связана с яблоней, и предки её носителя, вероятно, имели отношение к садоводству или жили в местности, где яблони были приметной деталью пейзажа.