Фамилия Онюшев образована от разговорной формы крестильного имени Ананий. В переводе с древнееврейского Ананий означает «отмеченный милостью Божией». Цепочка преобразований выглядит так: Ананий — Анан — Онан — Онюш. Именно эта последняя, народная форма и легла в основу фамилии, а суффикс -ев указывает на принадлежность потомку человека по имени Онюш: «сын Онюша», «Онюшев».

Покровителем этого имени считают священномученика Анания, апостола от семидесяти и епископа Дамасского. По преданию, из Дамаска он отправился в Елевферополь, где проповедовал, исцелял больных и обратил многих в христианство. Эта версия происхождения фамилии выглядит наиболее убедительной, поскольку имя Ананий было широко распространено в крестьянской и мещанской среде, где его часто сокращали до просторечных форм.

Существует и альтернативная гипотеза, менее вероятная. Согласно ей, Онюш — уменьшительная форма другого крестильного имени, Онуфрий, которое переводится с древнееврейского как «священный бык». Однако цепочка от Онуфрия к Онюшу фонетически менее естественна, чем плавный переход от Анания. К тому же форма Онюш встречается в документах именно как производная от Анания, тогда как для Онуфрия типичны такие варианты, как Онуш или Онош.

Сама фамилия Онюшев — редкая, она не попала в крупные общерусские справочники, но бытует в Поволжье и на Урале, где в XVII–XIX веках оседали выходцы из центральных губерний. Там имя Онюш фиксировалось в переписных книгах, и от него без труда образовывались отчества, закреплявшиеся затем за целыми семьями. Так что предки носителей фамилии, скорее всего, были простыми людьми — крестьянами или посадскими, чье имя в быту звучало коротко и по-домашнему: Онюш.

Интересно, что в некоторых говорах конечное -ш в имени Онюш смягчалось, из-за чего в документах встречаются колебания в написании: Онушев и Онюшев. Современное написание с буквой «ю» закрепилось как более точное отражение произношения.