Фамилия Пачушкина — женская форма, а её мужской вариант Пачушкин. С точки зрения словообразования перед нами типичная модель с суффиксом -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — «Пачушкин», то есть сын или потомок человека по прозвищу или имени Пачушка.

Самая вероятная основа — прозвище Пачушка. В северных и центральных говорах России «пачка» или «пачушка» означало нечто мягкое, рыхлое, комковатое — например, ком глины, снежка или даже ломоть хлеба. Так могли прозвать человека плотного, мягкотелого или медлительного, либо того, кто работал с глиной (гончар, печник). В словаре Владимира Даля зафиксирован глагол «пачкать» — марать, грязнить, и «пачкотня» — грязная работа. Отсюда же идёт версия, что Пачушкой в насмешку называли неопрятного, чумазого человека или ребёнка.

Более редкая, но возможная гипотеза связывает фамилию с уменьшительной формой крестильного имени Павел. В народной речи Павла могли называть Паша, Пашата, Пашута, а Пачушка — это уже местный, диалектный вариант той же уменьшительной формы, с характерным для некоторых говоров смягчением «ш» в «ч». В пользу этой версии говорит то, что фамилий от канонических имён через уменьшительные суффиксы — огромное множество, и Пачушкин может стоять в одном ряду с Пашутиным или Пашковым.

Географически фамилия Пачушкин встречается нечасто, но прослеживается в Вологодской, Кировской и Архангельской областях — то есть на Русском Севере, где хорошо сохранились старые прозвища и диалектные слова. Встречается она и в мордовских регионах, но там, скорее всего, это результат переселения или русификации местных фамилий.

Таким образом, предок современных Пачушкиных мог быть либо гончаром с перепачканными руками, либо медлительным увальнем, либо просто Павлом, которого в деревне звали ласково Пачушкой. Спор между этими версиями решает только семейная история и местные предания, но первая — прозвищная — выглядит чуть убедительнее из-за прямой связи с живым диалектным словом.