Фамилия Палушкина — женская форма, в основе которой лежит мужская фамилия Палушкин. Разбирать её стоит с мужского варианта, а он образован по простой и ясной модели: от прозвища или имени Палушка с помощью патронимического суффикса -ин. Суффикс указывает на принадлежность: «сын Палушки» или «внук Палушки». Само имя или прозвище Палушка — это уменьшительно-ласкательная форма от Павел, через народный вариант Павел → Павлушка → Палушка. Усечение и замена «в» на «л» встречаются в диалектах, особенно в северных и центральных говорах, где звук «в» перед «л» мог упрощаться.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с диалектным словом «палуш» или «палушка». В некоторых областях так называли небольшой мешок, сумку или даже деталь одежды (например, пазуху). В этом случае прозвище Палушка мог получить человек, носивший при себе мешочек, либо торгаш, либо просто тот, у кого была заметная деталь в одежде. Но первая версия — от имени Павел — гораздо естественнее, так как уменьшительные формы от канонических имён — основной источник русских фамилий.

Географически фамилия Палушкин (и Палушкина) встречается нечасто, но очагово — в старых записях по Тверской, Псковской и Новгородской губерниям. Это регионы, где хорошо сохранились древние новгородские диалектные черты, в том числе и фонетические переходы, вроде «Палушка» из «Павлушка». Социально фамилия могла принадлежать крестьянам или посадским людям: фамилии на -ин от уменьшительных имён в XVII–XVIII веках были массовыми у непривилегированных сословий.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Павлушкин, Павлов, Павлюков) показывает, что Палушкин — более редкий, диалектный вариант. Если Павлушкин образован прямо от Павлушка, то Палушкин — результат местного произносительного сдвига. В словаре Б. Унбегауна упоминается, что фамилии с таким чередованием (в → л) фиксируются именно в северо-западных говорах, что подтверждает гипотезу.

Таким образом, носительница фамилии Палушкина может считать, что её предки по мужской линии звались Палушками — скорее всего, Павлами на местный лад, из тех краёв, где язык менял звуки так, как было удобно.