Фамилия Пагер — редкий случай, когда корень почти наверняка указывает на конкретное занятие предка, и это занятие не из крестьянских. Основа фамилии восходит к немецкому слову Pager, которое в диалектах и историческом контексте означало не «пейджер» (это значение появилось только в XX веке), а «разносчик писем, посыльный, гонец». В баварских и австрийских говорах Pager или Bager — это человек, который ходил пешком или ездил с поручениями, часто между городами или от одного ведомства к другому.

Фамилия образована без русского суффикса — она пришла в готовом виде, скорее всего, с переселенцами из немецкоязычных земель. В Российской империи немецкие фамилии на -ер нередко сохраняли исходную форму, особенно если носители принадлежали к городским сословиям или к колонистам, приглашённым Екатериной II. Суффикс -er в немецком языке — типичный агентивный показатель, то есть «тот, кто делает»: Pager — «тот, кто пагует» (от глагола pagen — «ходить пешком, посылать с поручением»).

Встречается фамилия и в несколько ином написании — Pager, Pagher, — что может указывать на вариативность в записи при переходе из латиницы в кириллицу. Если предок был почтальоном, курьером или даже мелким чиновником, разносившим бумаги, фамилия закрепилась за ним как профессиональное прозвище. В отличие от многих русских фамилий, образованных от прозвищ по внешности или характеру, Пагер — прямое указание на род деятельности, что делает её более прозрачной для этимолога.

Географически фамилия тяготеет к западным губерниям Российской империи — Волынской, Подольской, Киевской, где существовали немецкие колонии, а также к Прибалтике. В современной России Пагеры встречаются редко, чаще — в странах бывшего СССР, куда фамилия попала с волнами переселения немцев в XVIII–XIX веках. Спорных версий происхождения почти нет: славянская основа для «Пагер» не прослеживается, а попытки связать её с польским pager (от pag — «пень») лингвистически слабы и не подтверждаются историческими записями.