Фамилия Пацер — редкий случай, когда её происхождение почти наверняка связано не с русским, а с польским или западнорусским (белорусским) языком. В отличие от типичных русских фамилий на -ов или -ин, суффикс -ер указывает на польскую или немецкую модель образования. Чаще всего такие фамилии в Польше и на западе бывшей Речи Посполитой давали по профессии или характерному занятию.

Корень «пац» в польском языке имеет два основных значения. Первое и самое вероятное — «paca» (читается как «паца»), то есть штукатурная кельма, мастерок. Соответственно, «pacer» (Пацер) — это штукатур, мастер по отделке стен. Фамилия образована по той же логике, что и польские Малер (маляр), Слюсарж (слесарь) или Токарж (токарь). Предок носителя этой фамилии, скорее всего, был строителем-отделочником.

Второй вариант, менее очевидный, — связь с польским «pacyć» (пацычь), что в диалектах означает «бить, колотить». В этом случае прозвище Пацер мог получить драчун или человек с тяжёлой рукой. Однако для фамилий, образованных от глаголов, в польском языке чаще использовались суффиксы -ак, -ик, а -ер характерен именно для названий профессий, особенно заимствованных из немецкого через посредничество польского. Поэтому версия со штукатуром намного весомее.

География фамилии подтверждает западнославянское происхождение. В России Пацеры встречаются редко, сосредоточены в западных областях (Брянская, Смоленская, Псковская) или в среде потомков переселенцев из Царства Польского и белорусских губерний. В самой Польше фамилия Pacer также фиксируется, но не входит в число распространённых.

Интересная деталь: написание через «ц» (Пацер) — это русская транслитерация польского «Pacer». Если бы фамилия была исконно русской, она, скорее всего, выглядела бы как Пацеров или Пацерин. Сохранение суффикса -ер без адаптации — прямое указание на то, что фамилия пришла в русскую среду в готовом, не переоформленном виде, что типично для польской шляхты и мещан, переселившихся в Российскую империю в XVIII–XIX веках.