Фамилия Пагор — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В отличие от большинства русских фамилий на -ов/-ев или -ин, она не имеет стандартного патронимического суффикса и не указывает на отца или деда. Её форма предполагает либо прозвищное происхождение, либо, что вероятнее, заимствование из другого языка.

Самая правдоподобная версия связывает фамилию с западноукраинским или польским словом «пагор» — так в некоторых говорах называют холм, возвышенность, пригорок (ср. украинское «пагорб»). В этом случае прозвище мог получить человек, живший на возвышенности, или выходец из села с похожим названием. В польском языке есть слово pagór (холм), и фамилия Пагор могла возникнуть в среде польской шляхты или крестьянства на землях бывшей Речи Посполитой. Позже, при переселении или в ходе миграций, она перешла в русскую среду, сохранив исходную форму без обрусевшего суффикса.

Менее вероятная версия — связь с диалектным глаголом «пагорить» (говорить, болтать) или с личным именем Пётр в его сокращённой форме (Пагор как вариант Пагоря). Но эти гипотезы слабые: следов такого имени в исторических документах нет, а глагол «пагорить» слишком локальный и редкий.

Фамилия Пагор не входит в число дворянских или купеческих родов. Скорее всего, её носители — крестьяне или мещане из западных губерний Российской империи (Волынская, Гродненская, Подольская). Встречается она и сегодня, но очень редко: по данным открытых телефонных справочников, основные носители живут на западе Украины, в Беларуси и в центральной России.

Словообразовательная модель проста: основа «пагор» без суффикса — это типичная для прозвищ и топонимических фамилий «чистая» форма, характерная для украинской и польской ономастики. В русской традиции такие фамилии часто переделывали в Пагоров, но вариант Пагор сохранился, что подчёркивает его западное происхождение.