Фамилия Паликин — наглядный пример того, как прозвище, данное по внешности или характеру, закрепилось в роду. Её основа — слово «палика», которое в русских говорах имело два основных значения. Первое и самое вероятное: «палика» — это задира, драчун, буян, тот, кто «палит» (бьёт, колотит). Второе значение, более редкое и локальное: так называли человека с большими, навыкате глазами (от глагола «палить» — смотреть пристально, выпучив глаза). Оба варианта ведут к одному корню — прозвищу, которое давали либо за буйный нрав, либо за особую внешность.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Паликин, то есть сын или потомок Палики. Эта модель типична для прозвищных фамилий, возникших в XV–XVII веках в среде крестьян и посадских людей. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от имён на твёрдый согласный, суффикс -ин крепился к основам на -а/-я, что и случилось здесь.

Географически фамилия Паликин тяготеет к северным и центральным областям России. Встречается в архангельских, вологодских, костромских и нижегородских документах. Сравнительно редкая, она не получила массового распространения, что косвенно подтверждает её происхождение от личного прозвища, а не от имени святого или географического названия.

Любопытная деталь: в некоторых говорах слово «палика» имело ироничный оттенок — так могли назвать не столько реального драчуна, сколько хвастуна или крикуна, который больше шумит, чем дерется. Таким образом, предок носителей фамилии мог быть человеком с громким голосом и горячим темпераментом, а не обязательно забиякой с кулаками.