Фамилия Панечко звучит на украинский лад, и это сразу подсказывает, где искать её корни. Перед нами уменьшительная форма имени Панко, а само Панко — это народная, «домашняя» версия целого ряда крестильных имён. Чаще всего за ним стоит Павел (от латинского «маленький»), но также Панфил (греч. «общий друг»), Панкратий (греч. «целомудренный»), Пафнутий (от египетского «принадлежащий Богу») или редкое Олимпан (греч. «небесный»).

Суффикс -ко в украинской традиции — один из самых распространённых маркеров фамилии. Он превращал личное имя или прозвище в семейное прозвание, отвечая на вопрос «чей ты?», то есть «сын такого-то». Панко со временем превратилось в Панечко через промежуточную ласкательную форму Панец. Такой двойной уменьшительный суффикс (-ец + -ко) встречается реже, чем простое -ко, и придаёт фамилии особый оттенок: она могла закрепиться за младшим сыном или просто за человеком, которого в семье звали особенно ласково.

Стоит упомянуть и менее очевидный путь. Не исключено, что фамилия образована от женских имён, которые в быту тоже сокращали до Панко: Евпраксия (греч. «благотворительница»), Павла (лат. «маленькая»), Полина (греч. «принадлежащая Аполлону»), Прасковья (греч. «пятница») или Степанида (греч. «кольцо, венок»). В украинских сёлах женщину могли звать Панко или Панечка, и тогда её дети, особенно если она была вдовой или держала двор, получали прозвание по матери. Эта версия не основная, но для фамилий с суффиксом -ко она вполне реальна.

Сам суффикс -ко в украинской ономастике выполнял роль, схожую с русским -ов/-ев: он указывал на родство. Но если русские фамилии чаще застывали в форме притяжательного прилагательного (Павлов, Панков), то украинские сохранили живую уменьшительность. Фамилия Панечко — пример того, как имя собственное прошло путь от церковного календаря до тёплого домашнего прозвища и лишь потом стало официальным родовым именем.

Географически фамилия тяготеет к западным и центральным областям Украины, где суффикс -ко особенно плотно покрывает карту фамилий. В России она встречается реже и часто указывает на украинские корни предков. Точных данных о первом носителе или известных исторических личностях с этой фамилией нет — она осталась в разряде семейных имён, которые не попали в громкие летописи, но сохранили память о предке по имени Панко.